1969.09-1973.09 四川省合川县临渡公社知青；

1973.09-1975.07 四川省江津师范学校体育专业学习；

1975.07-1978.03 四川省合川县肖家公社小学体育教师；1978.03-1978.09 四川省合川县师范学校教师；

1978.09-1982.09 北京师范大学生物系生物专业学习；

1982.09-1985.07 西南师范学院生物系动物学专业学习，获理学硕士学位；

1985.07-1989.08 西南师范大学助教（其间：1986.09-1989.07北京师范大学生物系生态学专业学习，获理学博士学位）；

1989.08-1990.10 西南师范大学讲师；

1990.10-1992.12 西南师范大学生物系副教授；

1992.12-2000.11 西南师范大学生物系教授，1996.05任水产科学研究所所长，1997.05兼九三学社市委副主委，1997.08聘为博士生导师（其间：1993.12-1995.01在英国Stirling大学鱼类营养学专业作博士后研究工作1998.08-1999.02在美国Miami大学作高级访问学者）；

2000.11—2002.04 重庆市农办副主任兼九三学社重庆市委副主委

2002.04—2003.01 九三学社重庆市委主委，市农办副主任，2002.12九三学社中央常委

2003.01—2007.12 九三学社中央常委、重庆市委主委，重庆市政府副市长

2007.12—2011.01 九三学社中央副主席、重庆市委主委，重庆市政府副市长

2011.01—2013.01 九三学社中央副主席、重庆市委主委，政协重庆市第三届委员会副主席。

2013.01—2016.12九三学社中央副主席、重庆市委主委，政协重庆市第四届委员会副主席。

2016.12—2017.01九三学社中央副主席，政协重庆市第四届委员会副主席。

2017.01——九三学社中央副主席。

九三学社第十届中央委员会委员、第十一届中央委员会常委、第十二届中央委员会副主席；重庆市第一届委员会副主委，第二、三届委员会主委。第十届全国政协委员，重庆市第一届政协常委；第十一届全国人大代表，重庆市第二届人大代表。

2011年1月12日上午，政协重庆市第三届委员会第四次会议，在人民大礼堂举行了闭幕会。会上，通过集体投票，增选谢小军为重庆市第三届委员会副主席。

2016年12月10日，九三学社重庆市委会四届八次全委会召开。会议还选举市卫生计生委主任屈谦为九三学社重庆市委会新任主委。 谢小军不再担任。

2017年1月18日，重庆市政协四届五次会议举行第三次大会，通过谢小军辞去政协重庆市第四届委员会副主席的决定。