马进良少年习武，身手矫健，“甫弱冠从戎，技勇冠军”。①隶甘肃总兵孙思克麾下，驻防河西凉州一带。由于作战勇敢，“由行伍拔补把总，迁千总”。②康熙十二年 （1673年），吴三桂叛乱，陕西提督王辅臣于次年据平凉叛应，攻陷兰州，临挑、巩昌等附。吴三桂从四川派兵声援，一时震动陕甘，从西北方面形成对清廷的严重威胁。

康熙十四年（1675年）三月，“以甘肃提督张勇为靖逆将军，加总兵孙思克左都督，王进宝都督同知，讨王辅臣”孙思克离开河西，率部东渡黄河，克靖远及附近城镇。和张勇围巩昌，旋又奉命赴援秦州，下礼县、清水、伏羌（令甘谷）等县。后再回师巩昌，王辅臣守将投降，河东大片地区平定。这些战役，马进良应围攻乎凉，是击败王辅臣的最后一战。孙思克“率师出静宁，击败辅臣将李国梁，斩级五百，获种将三，复其城。进次华亭，辅臣将高鼎率俾将二十八、兵千余，迎降。遂至平凉，与贝勒洞鄂师会。”孙思克战 斗中奋勇当先，屡战屡胜，但不幸右臂被砍，伤势严重，不能督战。马进良得知后高喊：“所我总兵手，我 必杀之！”遂闯入敌阵，斩杀砍伤孙思克臂之敌，取得胜利，马进良身亦多处负伤。康熙十五年（167 6年），王辅臣势穷投降，平凉之战结束，吴三桂之乱西翼被平定。孙思克因功耀凉州提督，仍回凉州。马进良。升授守备，迁山丹营游击，”仍在孙思克部下。

孙思克对马进良十分赏识，上疏荐举，说“进良随臣征剿有年，深知其谋勇兼全，请练军务。自调补巨标游击以来，每迁发防御，果敢争趋，且爱士卒、得人心，请就近题补巨标中军参将”康熙帝特允所请。康熙三十三年（1694年），授马进良直隶石匣副将。马进良离开孙思克部。三十四年再拔为右北口总兵官。石匣副将是要职，右北口是京北重镇，从此马进良戍守京北门户，担当军事重任。

康熙三十五年（1696年）正月，马进良入觐，康熙赐冠服。三月，奉命随征噶尔丹，马进良率兵一千五百，扈从康熙帝亲征。大兵分三路，康熙帝自统中路，发布命令说：“行军法令最为紧要，奋勇前进者赏功，怯敌退后者治罪，此系定例。马进良与总兵岳界龙、白斌均才力壮健，素有谋略，经朕简用倚任之人。”给予了马进良特殊信任。战斗中，康熙哈率兵前行，诸军以次进发，抵克鲁伦河，噶尔丹知圣驾亲来大惊，尽弃庐帐器械逃去。甲子，上亲率前锋兵穷追，噶尔丹仓皇道走，沿途遗弃器物。”取得征噶尔丹的胜利。马进良在征战中“多著奇迹”康熙三十八年（1699年）被赐“骁勇将军”额，次年赏戴孔雀翎，四十二年 （17 03年）再拨直隶提督，达到其戎马生涯的顶峰。

马进良在直隶提督任上，整饬营伍，练严明，军政皆佳，受到康熙谕奖。四十五年（1706年），马进良上疏，请求在哈喇和屯地方为官兵修建营房，兵部题交马进良设法建造，康熙怕“扣除兵他”，影响防务，谕令内务府拨给。马进良在古北口任上度过了将近二十个年头。康熙五十二年（一说五十三年，公元1713或1714年），马进良“以老乞休”。康熙览其疏“情词恳切”，命以原官致性，辞官归乡。家乡一时引为光荣。马进良在西宁北关建修了一个礼拜寺。

康熙五十六年 （1717年），马进良卒于家。康熙十分悲痛，说：“马进良效力多年，勤劳掘著，予告末久，忽闻温逝，朕心深表轶侧。”谥号襄毅。马进良的家乡对马进良十分敬重，《西宁府新志》上说他“居衷诚笃”，“已入乡贤”。