吴雪琴出生在一个书香门第之家，其父鸿典，字从五，是清光绪元年（1875年）的乙亥恩科副榜。3岁时母亲谢氏因病去世，刚满12岁父亲又病故，全家不得不由大伯收养。继母高氏尽管生有2女，不过仍待雪琴如同亲生。吴雪琴少时学习勤奋，常闭户读书。面对一贫如洗的家庭，他感到前途渺茫，欲别母投江。继母闻讯，急忙寻至江边，顿时母子俩抱头大哭一场。

青少年时代，吴雪琴能受教育，多蒙他的好友曾华臣、徐星垣等先生关照。曾华臣先生见雪琴诗文习作后感慨地说：“此子诗学当有成，可来我处志读。”于是收下雪琴免费随馆就读。曾华臣是清末简州的文化名人，擅长诗歌、楹联，著有《橘园诗抄》、《橘园联语》。后来，雪琴终于学有所成，于清光绪二十一年（1896年）八月考中秀才。不久与罗英贤之长女结婚。

清光绪二十九年（1904年），经曾华臣先生举荐，雪琴被清政府选派赴日本东京留学，入宏文学院速成班，攻读教育行政。同行人有刘存厚。求学期间，曾参加孙中山先生在日本组织的同盟会。

清光绪三十一年（1906年），雪琴学成归国，接任简州（今简阳市）学务局副董，筹办学校事宜。同年高等小学校改为官立中学校，雪琴兼任官立中学校监督（校长），为办学经费、校舍等问题奔忙。

清光绪三十三年（1908年）雪琴任简州劝学所视学，努力为创办简州女子高等小学校尽心尽力。同时，动员石经寺方丈圣友法师创办石经寺私立小学，为乡村民众子弟入学创造条件。

民国元年（1912年）春，雪琴辞去劝学所视学职务。7月，任临时四川省议会议员，并先后任四川省立第一中学、国立成都高等师范、四川优级师范学校、四川国学专门学校学监。两度在四川省师范学校遂宁第三师范学校任教。

吴雪琴在四川国学专门学校任学监时，与校长骆成骧交谊甚厚。民国13年（1924年），骆成骧曾至石经寺的雪琴家相访。留有石经寺同吴雪琴、林百熙、演明游长松寺诗。诗曰：■嵝满地九重高，独立沧溟踏巨鳌，乘兴似随云雨去，长风万里听波涛。

民国20年（1931年）3月，雪琴奉命回简阳县任教育局局长。其间，主张男、女生分校。

民国27年（1938年）调任简阳县民众教育馆馆长。1948年辞职回石经寺家中闲居。

1952年7月，吴雪琴因患“背瘩”病（背上长恶疮），接连几个月卧床不起。时值初秋，他强忍着巨痛，在床上为外甥赖高翔复信和和诗——《祝寿诗》。这年深秋的一天，吴雪琴不幸病逝，享年80岁。

雪琴生活俭朴，对人和善，颇受乡人敬慕，一生淡薄功名利禄，出任公职多受朋友敦请。民众教育是早期的职业教育和成人教育，它是一种民族自救运动，主要以成人为教育对象，内容包括健康、公民、生计、文化、艺术、家事等。吴雪琴重视乡村教育，积极开展乡村教育实验，主张“农忙时少学，农闲时多学”。学习的内容有疏通河道、淘修沟渠、修桥铺路、栽桑育蚕、水果栽培、织棉纺布。