1993年起，内帕尔当选尼共（联合马列）总书记，此后多次连任。在他看来，武装斗争并不是解决问题的唯一手段，尼泊尔内战可以通过谈判加以解决。在尼泊尔上世纪90年代实行君主立宪的多党议会制期间，尼共（联合马列）开始参与议会政治。他曾于1994年担任尼泊尔副首相兼国防和外交大臣，当时尼共（联合马列）领导人阿迪卡里任尼泊尔首相。

2001年，内帕尔曾因参与反对政府的抗议活动被捕，后来获释。此后，内帕尔领导尼共（联合马列）加入了反对国王专制统治、争取在尼泊尔实现民主政治的斗争。2008年4月10日，尼泊尔举行制宪会议选举，由于尼共（联合马列）在竞选中表现不佳，遭受重大挫折，内帕尔引咎辞职。

2009年1月13日，尼泊尔制宪会议以压倒性多数选举内帕尔担任宪法委员会主席。内帕尔在宣誓就职后说，领导宪法委员会对他而言是挑战也是机会，他将整合各党意见，在规定时间内完成宪法制定工作。2月，尼共（联合马列）选举出新领导集体，卡纳尔获选该党重新设立的主席这一最高职位，内帕尔则被任命为该党高级领导人、中央委员会常务委员。

5月3日，尼联共（毛主义）主导的内阁会议决定解除政府军参谋长鲁克曼古德·卡特瓦尔的职务，但未获参与执政联盟的尼共（联合马列）的支持，导致尼共（联合马列）退出政府。尼总统拉姆·亚达夫同日致电要求遭解职的卡特瓦尔留任，引发了尼联共（毛主义）的指责和抗议，最终促使尼联共（毛主义）主席普拉昌达4日宣布辞去政府总理职务。其后，亚达夫总统要求制宪会议通过选举产生新总理。

5月23日，尼泊尔制宪会议召开会议，选举内帕尔为新一届政府总理。5月25日，内帕尔就任尼泊尔联邦民主共和国总理。尼泊尔总统亚达夫在首都加德满都总统府主持了就职仪式。尼泊尔政府各级代表、各政党领导人和外国使节等出席了就职仪式。

内帕尔的妻子也是尼共（联合马列）党员，他们育有一子一女。