他先后为专科、本科、硕士、博士、中医、西学中医、成人教育、自学考试、中医进修班、留学生等不同专业、不同层次的学生讲授中医基础、中医诊断学、中医诊断学专论、中医诊断学研究进展等课程。先后培养硕士研究生11人，博士研究生8人。他还长期坚持带学生下基层开展社会实践医疗服务活动，曾先后5次评为四川省暑期社会实践优秀教师。

他积极从事科研工作，担任了国家重点古籍整理项目《中华大典·医学分典，诊法总部》主编。担任了国家自然科学基金“肾为先天之本遗传行为的实验研究”、“肾为先天之本遗传行为的基因表达研究”、“用基因芯片研究肾阳虚证的基因表达谱”、“虚寒证的基因组学研究及数学研究”、“肾阳虚证家族能量代谢信号转导通路Ras/MAPK研究”等5个课题的主研。

在繁忙的教学科研工作的同时严教授长期坚持临床医疗工作，在吸取继承前辈传统的基础上勤于思考，不断创新，具备了丰富的临床经验和高超的医疗技术，尤其在消化系统疾病、呼吸系统疾病等多种疑难杂症以及肿瘤早期和放化疗后的治疗方面有独到的见解。

他出版了各种学术专著、教材和教学参考书。主编《中华大典·医学分典·诊法总部》《中医五脏病机学—心病之病机》《中医基础理论考试参考书》《中医基础理论考试大纲》《中医诊断学解题指导》。担任了《中华自然养生保健》副主编，作为编委参与全国中医药高级丛书《中医基础理论》、全国中医规划教材《中医诊断学》《中医诊断学习题集》、全国中医研究生教材《中医诊断学》、全国中医精编教材《中医诊断学》等11部教材、教参的撰写。发表论文80余篇。获教育部自然科学二等奖1项，四川省科技进步而二等奖1项，中华中医药学会科学技术三等奖1项。

在学术上，他提出“寒火”的理论，认为寒证热证每一个辨证要素都具有表现本质和假象的双重意义，做出了“阴证似阳论寒火—热象主寒证”、“阳证似阴论热证—寒象主热证”的重要论述。他深入、全面、系统地开展了中医五脏病机的研究，已写成专著，用中英文对照，在美国正式发行。在深入研究“异病同证”、“异病同治”的理论中，他提出了“同证异治”，从而提出“脏腑辨证细化分型”的辨证体系，认为目前脏腑辨证的许多证型属于基础证候，受病的主要病机的影响，同一证候随着主要病机发展趋势和主症表现的不同，必须深入进行细分化型，使之成为定位定性更为精确，针对性更强的辨证类型。他还应用分子流行病学的方法，对虚寒证候、七情证候、肾虚证候的辨证因子进行量化评分，并从分子水平上进行基因表达的探索，从宏观和微观的角度对证候的标准化、客观化进行深入研究。