1986年7月毕业于中央财政金融学院基建财务与信用专业，获经济学学士学位。

1999年4月，获经济学硕士学位。2003年7月毕业于中央财经大学国民经济学专业，获经济学博士学位。

1986年毕业后留校在中央财政金融学院基建经济系任教，1992年任讲师，1999年任副教授，2005年晋升教授，2007年被评为博士生导师。

1997年任投资经济系副主任。

2000年任教务处副处长，2003年任投资经济系主任，2005年任校长助理兼投资经济系主任。

2007年起任中央财经大学副校长。

2007年6月，任中央财经大学副校长。

2017年9月，中央财经大学校长、党委副书记。

中国投资学会常务理事，商业部 “中埃苏伊士经济区合作项目中方政策研究小组”顾问。　

2017年9月27日，教育部党组成员、副部长林蕙青在中央财经大学宣布了教育部党组的任免决定，王瑶琪任中央财经大学校长、党委副书记。