侯康明在地震地质、工程地质和地球物理领域科研成绩突出。在“七五”至“九五”期间，承担过12项纵向研究课题，其中1项为国家“9·73”重大科研项目子项目。3项为地震科学联合基金项目，本人负责或专题负责的课题5项，作为主要完成人参加过的课题有6项。其中作为主要完成人完成的中国地震局“七五”重点项目“昌马活动断裂研究”，获中国地震局科技进步二等奖；专题负责完成的“八五”重点项目“祁连山活动断裂1：5万地质填图”，获省部级科技进步二等奖；作为业务技术负责人完成的中国地震局重点项目“偶极电测深法预报地震的试验研究”，获厅局级科技进步三等奖，

1998年被甘肃省地质学会授予《甘肃青年地质科技奖》。参加过4次地震现场考察，1999年参加中国地震局组织的藏北无人区玛尼地震现场考察，被中国地震局授予“地震科考勇士”称号。1998年被评为中国地震局“跨世纪科技人才”和甘肃省“跨世纪学术技术带头人”（333计划）。与人合写专著一本，发表了《断层崖形成年代的数学模拟计算》、《对古浪8级大震孕育和发生的构造环境及发震模型的讨论》、《玛尼地震地表破裂基本特征研究》等20余篇论文。“十五”期间，参加编写了《南京市等两城市活动断裂探测及地震危险性预测》重大项目建议书。