吕秀芝1993年出生于歙县王村。

2005年冬，在王村中学举行的校运动会上，上初一的吕秀芝在1500米长跑比赛中拿了第3名。赛后，体育老师卢鹏让吕秀芝跟随练长跑。

2007年，黄山市举行中学生田径运动会，首次设立竞走项目；8月，父亲吕锦荣把吕秀芝送进黄山市业余体校进行专门训练。

2008年市里教练推荐吕秀芝到江苏淮安体校接受竞走专业训练，吕锦荣夫妇也跟着女儿到了淮安，边打工边陪读。

2009年底，接受竞走专业训练才一年多的吕秀芝，被挑选进入刚刚重组的安徽省田径竞走队，开始了专业运动员生涯；同年代表安徽田径队参加了全国中学生运动会，带伤获得女子3000米竞走第八名。

2010年在全国竞走锦标赛暨世界杯选拔赛中，吕秀芝获女子少年组第3名，达到国家一级运动员标准；

2011年3月11日至13日，在第七届全国城市运动会竞走预选赛暨全国竞走大奖赛中，吕秀芝又以1小时32分31秒的优异成绩一举摘得女子青年组20公里冠军；同年6月吕秀芝正式进入国家队；从师奥运冠军教练张阜新。

2012年3月在江苏太仓进行的国际田联竞走挑战赛暨奥运会选拔赛中吕秀芝以1小时57分28秒获得银牌；5月13日在国际田联竞走世界杯中以1小时29分55秒完成比赛，获得第四名；8月12日参加伦敦奥运会女子20公里竞走项目并以1小时27分10秒的成绩最终获得第六名；9月13日至15日，2012国际田联竞走挑战赛总决赛暨全国竞走锦标赛在鄂尔多斯伊金霍洛旗举行，吕秀芝勇夺女子组10公里竞走项目季军；同年吕秀芝还被安徽工业大学公共管理与法学院录取。

2013年5月12日在第十二届全运会上女子20公里竞走中，以1小时27分53秒的成绩获得冠军。

2014年2月获得全国竞走大赛女子组冠军；同年9月28日在仁川亚运会上以1小时31分钟06秒拿下女子20公里项目金牌。

2015年8月28日，在北京田径世锦赛女子20公里竞走比赛中，吕秀芝以1小时27分45秒获得亚军。

2016年3月6日，在2016年全国竞走大奖赛暨奥运会选拔赛女子20公里竞走的比赛中，吕秀芝获得银牌。

2016年7月18日，中国田径队里约奥运名单出炉，吕秀芝入选。8月20日，里约奥运会女子20公里竞走决赛中，吕秀芝以1小时28分42秒的成绩获得铜牌。

2016年12月28日，被体育总局授予2016年度体育运动荣誉奖章。

2017年8月13日，2017年世界田径锦标赛女子20公里竞走，吕秀芝犯规被罚下。

2018年5月7日，吕秀芝以1小时29分51的成绩夺得2018年全国竞走大奖赛（3）暨亚运会竞走选拔赛女子20公里竞走冠军。

2010年3月，全国竞走大奖赛暨世界杯选拔赛-铜牌

2010年9月18日，田联竞走挑战赛总决赛暨全国竞走锦标赛-少年组冠军

2011年9月16日，全国竞走锦标赛暨奥运会达标赛-冠军

2012年5月13日，国际田联竞走世界杯-第四名

2012年8月12日，伦敦奥运会-第六名

2013年5月11日，第十二届全运会-冠军

2014年9月28日，亚运会-冠军

2015年8月28日，世界田径锦标赛-亚军

2016年5月8日，在意大利罗马进行的2016年国际田联竞走团体世锦赛结束了第一天争夺，中国队第三人吕秀芝以1小时28分36秒获得第6名。

2016年12月28日，被体育总局授予2016年度体育运动荣誉奖章。

2018年5月7日，吕秀芝以1小时29分51的成绩夺得2018年全国竞走大奖赛（3）暨亚运会竞走选拔赛女子20公里竞走冠军。

多年的专业训练，让吕秀芝从一名农家小丫成长为专业运动员，在多次国内国际大赛中崭露头角。比荣誉与鲜花更叫人感动的是，这个邻家女孩在梦想守望中，一直拥有的态度是那么阳光和坚韧。

她微笑着说过，只要不放弃，坚持自己的梦想，一步一步脚踏实地向前走，就一定会实现自己的梦想。

2011年吕秀芝全面爆发。在女子青年组20公里项目上接连夺得第七届全国城市运动会、全国竞走冠军赛和全国竞走锦标赛三项冠军。2012年3月，吕秀芝在国际田联竞走挑战赛暨奥运会选拔赛上，夺得女子竞走20公里亚军，成功入选奥运方阵，实现了人生的一次跨越。（黄山新闻网评价）

和世界高手相比，吕秀芝在技术、专项力量、综合素质等方面还需要完善，但她还年轻，而且她敢拼敢冲，越大的比赛她就越兴奋，这种感觉会让她在赛场上的脚步更加自信、轻盈。（教练芦鹏评价）