马美湖在国内外发表学术论文60余篇，主编全国性高校教材2本，出版专著或有关书籍8本，两项主持的成果获省科技进步三等奖，一项主要参加的成果获中国科学院二等奖，一项主要参加成果获省科技进步三等奖，一项主持课题获全国商业科技进步二等奖，多项主持的省级重点攻关课题已经完成鉴定，研究完成了“再制蛋四合一涂膜保鲜剂”、“鲜蛋涂膜保鲜剂”、“无铅加锌铜松花皮蛋”等课题，在全国率先研究提出了“鲜蛋EVSPT保鲜技术”。2003年，制定完成了农业部《无公害食品 鹌鹑蛋》强制性标准、《无公害食品 鲜鸭蛋》强制性标准。这两个标准于2004年3月1日颁布实施。2003年8月在北京主持审定了国家质检总局下达的《安全无公害食品鲜蛋》强制性国家标准。编著了《禽蛋制品生产技术》。

中国畜产品加工研究会蛋品委员会主任，国家农产品加工重大关键技术项目筛选组专家，发表论文130余篇，主编全国规划教材《蛋与蛋品加工学》等2本，出版著作5本，主持的课题获中国科学院科技进步二等奖1项，全国商业科技进步二等奖1项，省科技进步三等奖4项。主持完成《皮蛋现代生产新技术研究与示范》，研究出了新型代铅剂及合适的比例；研制出 KJ-004涂膜剂等4种保鲜剂；研究建立了清料法加工鹌鹑皮蛋的配方与技术；创建了“清料法生产”；建立了皮蛋料液循环利用技术，降低成本42℅，减少环境污染；研究出了“低钠K+型皮蛋”；突破了表面无斑点、无铅出口皮蛋生产技术难关；形成了先进的皮蛋现代化生产新工艺技术；研制成功皮蛋原料蛋自动处理和清洗、杀菌、涂膜等皮蛋成套机械，06年鉴定为国际先进水平。主持948项目《蛋品深加工关键技术引进与研发产业化示范项目》，对洁蛋、液体蛋、专用蛋粉、蛋壳综合利用等研究取得良好的进展。组织召开了5届中全国蛋品科技大会等，2004年11月在北京获得首届中国蛋品加工业“十大杰出人物”称号。主要研究方向为生物化学与分子生物学，食品生物技术，畜产食品科学理论与农副产品综合利用。2004年前往美国华盛顿州立大学、福罗里达大学交流访问，2006年前往丹麦、荷兰、法国、德国、意大利、捷克等欧洲6国考察访问。现任国家一级学会中国畜产品加工研究会常务理事，农业部国家农产品加工重大关键技术项目筛选组专家。2004年获首届中国蛋品加工业“十大杰出人物”称号；2005年月获第二届中国肉品加工业“十大杰出科技人物”称号。主持完成国家自然科学基金项目“屠宰场废血液生物降解与综合利用应用基础研究”（编号30270976）。主持的课题获中国科学院科技进步二等奖1项，全国商业科技进步二等奖1项，省科技进步三等奖4项。

近20年来，长期深入工厂与车间解决具体技术问题，积极为社会服务，促进全国畜产品加工行业的发展，产生了很好的社会效益；多次主持和参与全国的本行业科技活动，分别主持召开“第三届中国蛋品科技大会”（98年长沙），主持召开了“第四届中国蛋品科技大会”（00年昆明）、“第五届中国蛋品科技大会”（02年北京）、“第六届中国蛋品科技大会”（04年北京）、“中国蛋品工业发展座谈会”（04年北京）、“第七届中国蛋品科技大会”（06年北京）和“世界蛋品日在中国首次启动仪式”（06年北京），并参与组织召开了“第五届中国肉类科技大会”（05年北京），主持召开“第八届中国蛋品科技大会暨首届亚洲蛋品会议（08年武汉）”。