广东药学院硕士研究生导师、中山大学教授硕士研究生导师。

国率先开展应用于药物临床前安全性评价的大型实验动物的标准化，出版专著两部；在国内首先利用水生动物开展海洋环境污染物的生态毒理学评价工作，建立国家标准两项；较早开展实验动物比较组织学和比较病理学研究，提出建立安全评价毒性病理标准化的策略。近年来，积极应对欧盟安全性评价中动物试验禁令，在国内推行和开展动物试验替代方法的研究和标准制订工作，用于化妆品/食品/化学品的风险评估和毒理学评价。建立国内首家实验动物替代方法共识平台和评价中心。积极推行面向21世纪的毒理学策略，将干细胞技术、组织工程技术和“组学”技术应用于毒理学替代方法的研发，主持体外替代实验室，提供检测技术服务于商品进出口检验。指导培养博士硕士研究生6名。主编《实验动物替代方法原理与应用》（科学出版社）、《3R和仁慈准则》（科学出版社）等多部专著。国内外杂志发表科研论文80余篇，主持编写国家标准和检验检疫行业标准10多项，获国家发明专利4项。研究成果获广东省、上海市和质检总局科技进步二等奖5项，三等奖6项。

食品、化妆品等消费品的风险评估及毒理学评价中替代方法的研究与标准化

国家“九五”攻关项目“药物安全性评价实验常用实验动物的标准化（96A230606）”；广东省科技攻关课题“老年性痴呆恒河猴模型的研究（2KM04603S）”；广东省自然科学基金项目“猕猴骨髓干细胞体外培养及SHIV感染生物学特性研究(38042)”；国家自然科学基金项目“皮肤性评价特异性生物标记的筛选及器官型皮肤替代模型的建立（30670541）”；广东省科技攻关课题“化妆品皮肤毒性检验的壁垒性替代技术方法建立和标准制订（2005B32401010）”； “十一五”国家科技支撑计划项目“出入境检验检疫安全储备技术研究”（2006BAK10B09）;国家质检总局科技项目“化妆品危害性物质安全性和适应性评价技术研究”（2008IK257）；广东省科技攻关项目“动物实验替代技术的评估和共享”(2009B060300013).

程树军,潘芳.体外皮肤模型的生物标志研究进展,中国比较医学杂志, 2010,20(3):64-68

程树军,焦红,谈伟君.海洋生物毒素检测的动物试验替代方法及标准化，中国食品卫生杂志,2010,8

程树军,焦红毒性检测用皮肤模型InspecskinⅠ修复裸鼠皮肤缺损的研究,中山大学学报(医学版), 2009,29(2):132-136

ES细胞源表皮样干细胞与胶原海绵体外构建组织工程化皮肤,中山大学学报(医学版), 2006,27(1):4-6

GLP原则在体外毒理学评价实验室的应用,中国比较医学杂志, 2008,18(11):58-61

皮肤毒性检验中替代模型的研究进展和应用评价,毒理学杂志,2006,20(4):254-256

体外构建新型化妆品检测用皮肤Inspecskin的初步研究,毒理学杂志,2008,22(6):428-430