1925年在县内读完高小后，考入榆林职业中学。在革命思潮影响下积极参与游行集会，演出进步戏；假期回县内东乡发展农民协会。

1927年加入共青团。

1928年赴北京工业大学校办工厂实习，转入中国共产党，成为中共北方局的地下交通员。先后受杜自生、安子文等人领导，在京津、津沪、沪沈间传递党的密件、书刊。

1931年回米脂，任中共陕北特委秘书长、代理宣传部长兼互济会主任，与马明方、毕维周等一起参与土地革命和开辟苏区工作，历尽艰险。陕北特委遭受国民党严重破坏后，与鲁苯去北平找组织汇报，要求补充力量，继续活动。再度担任地下交通员，往来天津和陕北之间。

1935年4月，国民党25师地下共产党员高立仁（米脂人）叛变，出卖陕北在京革命者。崔运和马云程、高仰云等许多人被捕。

在敌严刑拷打下拒不招供。被判处8年徒刑，送往北平军人反省院。4次绝食，与敌斗争。芦沟桥事变后，部分难友出狱，他转至第一监狱，继续遭受迫害，带重镣，吃烂菜霉饭，两次法场陪刑，毫不屈服。后来，敌人竟给他注射毒针，致使他精神错乱，幻视幻听，大病不起。

1941年获释后辗转回乡，又去延安治疗，病情略有好转时便请求恢复工作。

1946年后历任中共张家口市委干部科长、石家庄市总工会秘书长、劳动局长等。在敌机狂轰滥炸危险关头，一人留守机关。

新中国成立后任石家庄市委秘书长。

1953年调任国务院外国专家局人事处长。健康状况时好时坏，多年带病从事力所能及的工作，从不计较个人得失。

1954年后治疗休养，仍念念不忘工作。病逝前两天，在半昏迷中嘱托亲属交纳党费。

“崔运不愧为硬骨头，忠诚的共产党人！”